JetSwap

Показывать сайт только уникальным посетителям - да.
Не показывать сайт посетителям с близкими IP-адресами - да.
Время уникальности IP-адресов: 48 часов.
Очистить куки (4 сек) - ALL.
Другие настройки не упоминал, так как они очевидны либо не имеют отношения к рассматриваемому вопросу.
Вопрос: почему при таких настройках почти все показы уходят в хиты (в одной ПП)? Можно ли ещё как-то "повысить уникальность"?

Вероятно хитами в ПП называются все повторные посещения с IP-адреса, может быть посуточно, а может и больше, по всей ПП, а не с вашего сайта в отдельности. Поскольку не только вы можете крутить определенную ПП в системе, то с IP-адресов серферов уже могут быть посещения данной ПП, отсюда низкий КДП.
Для начала было бы неплохо узнать правила учета кликов.
Должна помочь установка галочки "Эксклюзивные IP" - тогда точно в течение 48 часов минимум с определенного IP никакой активности в нашей системе не было.
Это правда не гарантирует, что он не был засвечен в ПП, но должно повысить процент учета хостов.